MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cycloclasticus zancles 7-ME plasmid p7ME01

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021918	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021918	TGGG	2	8	458	465	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021918	A	6	6	469	474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021918	CGA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021918	CGCC	2	8	784	791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_021918	C	7	7	790	796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_021918	TAA	2	6	1158	1163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021918	GCC	2	6	1265	1270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021918	TCCTT	2	10	1271	1280	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021918	CAT	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021918	AGG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021918	G	7	7	1463	1469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021918	GGA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021918	GGGA	2	8	1491	1498	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021918	G	6	6	1506	1511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021918	C	6	6	1515	1520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_021918	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021918	TA	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021918	AAAG	2	8	1625	1632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021918	A	7	7	1644	1650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021918	C	6	6	1764	1769	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_021918	GGCT	2	8	1862	1869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021918	AGT	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021918	TCAA	2	8	1960	1967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021918	CAAC	2	8	1982	1989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021918	CAA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021918	A	7	7	2040	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021918	ATG	2	6	2081	2086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021918	CCT	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021918	AG	3	6	3703	3708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021918	T	7	7	4099	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021918	A	7	7	4144	4150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021918	TA	3	6	4307	4312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021918	GA	3	6	18588	18593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021918	GAA	2	6	18608	18613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021918	TCCC	2	8	27049	27056	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_021918	CGG	2	6	32222	32227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021918	GTGA	2	8	32285	32292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021918	GCC	2	6	32300	32305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021918	TTG	2	6	32309	32314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021918	GTT	2	6	32351	32356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021918	AT	3	6	32420	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021918	TAAAG	2	10	32438	32447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021918	AGA	2	6	32455	32460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021918	GTTTAC	2	12	32524	32535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021918	ACA	2	6	34141	34146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021918	GCG	2	6	35881	35886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021918	TCT	2	6	35900	35905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021918	A	6	6	35936	35941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021918	CTGG	2	8	35978	35985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021918	A	6	6	36020	36025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021918	GTA	2	6	37086	37091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021918	TGT	2	6	37092	37097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021918	TAC	2	6	37109	37114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021918	TAC	2	6	37119	37124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021918	CAAG	2	8	37130	37137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021918	A	7	7	37156	37162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021918	GGGT	2	8	37182	37189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021918	GCC	2	6	37407	37412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021918	CTTT	2	8	37423	37430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021918	GCC	2	6	39559	39564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021918	GGTCA	2	10	39595	39604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021918	AG	3	6	40033	40038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021918	GTT	2	6	40351	40356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021918	AT	3	6	40387	40392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021918	TA	3	6	42333	42338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.